Protein–RNA interactions for Protein: O54950

Prkag1, 5'-AMP-activated protein kinase subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkag1O54950 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkag1O54950 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkag1O54950 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkag1O54950 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkag1O54950 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkag1O54950 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkag1O54950 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkag1O54950 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkag1O54950 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Prkag1O54950 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkag1O54950 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkag1O54950 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkag1O54950 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkag1O54950 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkag1O54950 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkag1O54950 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkag1O54950 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkag1O54950 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkag1O54950 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkag1O54950 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkag1O54950 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkag1O54950 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkag1O54950 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prkag1O54950 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkag1O54950 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prkag1O54950 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkag1O54950 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkag1O54950 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkag1O54950 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkag1O54950 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkag1O54950 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkag1O54950 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkag1O54950 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms