Protein–RNA interactions for Protein: O54907

Tnfsf12, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 12, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf12O54907 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Tnfsf12O54907 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tnfsf12O54907 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tnfsf12O54907 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf12O54907 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf12O54907 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf12O54907 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf12O54907 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf12O54907 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tnfsf12O54907 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf12O54907 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tnfsf12O54907 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms