Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Itgb3O54890 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Itgb3O54890 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Itgb3O54890 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb3O54890 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb3O54890 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb3O54890 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb3O54890 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Itgb3O54890 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb3O54890 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb3O54890 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Itgb3O54890 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb3O54890 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb3O54890 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb3O54890 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Itgb3O54890 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2298.5 ms