Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Rab33bO35963 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rab33bO35963 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Rab33bO35963 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rab33bO35963 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Rab33bO35963 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Rab33bO35963 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms