Protein–RNA interactions for Protein: O35526

Stx1a, Syntaxin-1A, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx1aO35526 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stx1aO35526 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Stx1aO35526 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stx1aO35526 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stx1aO35526 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stx1aO35526 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Stx1aO35526 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stx1aO35526 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stx1aO35526 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Stx1aO35526 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx1aO35526 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Stx1aO35526 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx1aO35526 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx1aO35526 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Stx1aO35526 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stx1aO35526 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stx1aO35526 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Stx1aO35526 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx1aO35526 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx1aO35526 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Stx1aO35526 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Stx1aO35526 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Stx1aO35526 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms