Protein–RNA interactions for Protein: O35427

Crcp, DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC9, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CrcpO35427 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CrcpO35427 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CrcpO35427 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CrcpO35427 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CrcpO35427 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CrcpO35427 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CrcpO35427 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CrcpO35427 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CrcpO35427 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CrcpO35427 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CrcpO35427 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CrcpO35427 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CrcpO35427 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
CrcpO35427 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CrcpO35427 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC26.93■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
CrcpO35427 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms