Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
Abcc1O35379 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
Abcc1O35379 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
Abcc1O35379 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC36.49■■■■□ 3.43
Abcc1O35379 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Abcc1O35379 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.47■■■■□ 3.43
Abcc1O35379 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
Abcc1O35379 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Abcc1O35379 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Abcc1O35379 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC36.46■■■■□ 3.43
Abcc1O35379 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
Abcc1O35379 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc1O35379 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc1O35379 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
Abcc1O35379 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
Abcc1O35379 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
Abcc1O35379 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Abcc1O35379 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
Abcc1O35379 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
Abcc1O35379 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
Abcc1O35379 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc1O35379 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc1O35379 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc1O35379 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
Abcc1O35379 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Abcc1O35379 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
Abcc1O35379 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc1O35379 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc1O35379 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc1O35379 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc1O35379 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc1O35379 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Abcc1O35379 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Abcc1O35379 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Abcc1O35379 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
Abcc1O35379 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abcc1O35379 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
Abcc1O35379 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc1O35379 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
Abcc1O35379 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
Abcc1O35379 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
Abcc1O35379 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
Abcc1O35379 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Abcc1O35379 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
Abcc1O35379 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Abcc1O35379 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
Abcc1O35379 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Abcc1O35379 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Abcc1O35379 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
Abcc1O35379 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abcc1O35379 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
Abcc1O35379 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
Abcc1O35379 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
Abcc1O35379 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
Abcc1O35379 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.39
Abcc1O35379 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Abcc1O35379 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Abcc1O35379 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
Abcc1O35379 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Abcc1O35379 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
Abcc1O35379 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc1O35379 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc1O35379 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
Abcc1O35379 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Abcc1O35379 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC36.22■■■■□ 3.39
Abcc1O35379 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
Abcc1O35379 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
Abcc1O35379 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
Abcc1O35379 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
Abcc1O35379 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc1O35379 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc1O35379 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
Abcc1O35379 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
Abcc1O35379 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Abcc1O35379 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Abcc1O35379 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Abcc1O35379 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc1O35379 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc1O35379 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc1O35379 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Abcc1O35379 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC36.14■■■■□ 3.38
Abcc1O35379 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Abcc1O35379 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
Abcc1O35379 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Abcc1O35379 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc1O35379 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc1O35379 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc1O35379 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC36.12■■■■□ 3.37
Abcc1O35379 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc1O35379 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
Abcc1O35379 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc1O35379 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc1O35379 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc1O35379 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
Abcc1O35379 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Abcc1O35379 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
Abcc1O35379 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc1O35379 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc1O35379 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
Abcc1O35379 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms