Protein–RNA interactions for Protein: O35114

Scarb2, Lysosome membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarb2O35114 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Scarb2O35114 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Scarb2O35114 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Scarb2O35114 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Scarb2O35114 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms