Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ArxO35085 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ArxO35085 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ArxO35085 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ArxO35085 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ArxO35085 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ArxO35085 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ArxO35085 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ArxO35085 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ArxO35085 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ArxO35085 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ArxO35085 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ArxO35085 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ArxO35085 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ArxO35085 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ArxO35085 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ArxO35085 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ArxO35085 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ArxO35085 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ArxO35085 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ArxO35085 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ArxO35085 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ArxO35085 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ArxO35085 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ArxO35085 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ArxO35085 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ArxO35085 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
ArxO35085 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ArxO35085 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ArxO35085 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
ArxO35085 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ArxO35085 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ArxO35085 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ArxO35085 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
ArxO35085 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ArxO35085 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ArxO35085 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ArxO35085 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
ArxO35085 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ArxO35085 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ArxO35085 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ArxO35085 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ArxO35085 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ArxO35085 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ArxO35085 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ArxO35085 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ArxO35085 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ArxO35085 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ArxO35085 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ArxO35085 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ArxO35085 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ArxO35085 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ArxO35085 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ArxO35085 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
ArxO35085 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ArxO35085 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ArxO35085 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
ArxO35085 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC28.14■■■□□ 2.1
ArxO35085 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ArxO35085 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
ArxO35085 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ArxO35085 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ArxO35085 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
ArxO35085 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ArxO35085 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ArxO35085 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ArxO35085 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ArxO35085 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ArxO35085 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
ArxO35085 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ArxO35085 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ArxO35085 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ArxO35085 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ArxO35085 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ArxO35085 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ArxO35085 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ArxO35085 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ArxO35085 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
ArxO35085 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ArxO35085 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
ArxO35085 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
ArxO35085 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ArxO35085 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ArxO35085 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ArxO35085 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ArxO35085 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ArxO35085 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ArxO35085 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ArxO35085 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ArxO35085 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ArxO35085 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ArxO35085 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ArxO35085 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ArxO35085 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ArxO35085 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
ArxO35085 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
ArxO35085 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ArxO35085 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ArxO35085 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
ArxO35085 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.3 ms