Protein–RNA interactions for Protein: O09165

Casq1, Calsequestrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 405 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq1O09165 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Casq1O09165 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Casq1O09165 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Casq1O09165 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Casq1O09165 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Casq1O09165 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Casq1O09165 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Casq1O09165 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Casq1O09165 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casq1O09165 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Casq1O09165 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Casq1O09165 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Casq1O09165 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Casq1O09165 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Casq1O09165 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Casq1O09165 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Casq1O09165 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Casq1O09165 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Casq1O09165 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Casq1O09165 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Casq1O09165 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Casq1O09165 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Casq1O09165 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Casq1O09165 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Casq1O09165 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Casq1O09165 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Casq1O09165 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Casq1O09165 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Casq1O09165 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Casq1O09165 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Casq1O09165 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms