Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

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Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Gm20939L7N243 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Gm20939L7N243 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Gm20939L7N243 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Gm20939L7N243 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
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