Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ19

Gm379, Predicted gene 379, mousemouse

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Length 296 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm379J3QQ19 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Gm379J3QQ19 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Gm379J3QQ19 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Gm379J3QQ19 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gm379J3QQ19 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
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