Protein–RNA interactions for Protein: J3QNS5

Mfsd4b4, Major facilitator superfamily domain-containing 4B4, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd4b4J3QNS5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Mfsd4b4J3QNS5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Mfsd4b4J3QNS5 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Mfsd4b4J3QNS5 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mfsd4b4J3QNS5 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mfsd4b4J3QNS5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Mfsd4b4J3QNS5 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mfsd4b4J3QNS5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mfsd4b4J3QNS5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mfsd4b4J3QNS5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Mfsd4b4J3QNS5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mfsd4b4J3QNS5 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mfsd4b4J3QNS5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mfsd4b4J3QNS5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mfsd4b4J3QNS5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Mfsd4b4J3QNS5 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mfsd4b4J3QNS5 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mfsd4b4J3QNS5 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mfsd4b4J3QNS5 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mfsd4b4J3QNS5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.5 ms