Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Sclt1G5E861 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Sclt1G5E861 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Sclt1G5E861 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sclt1G5E861 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Sclt1G5E861 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sclt1G5E861 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sclt1G5E861 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Sclt1G5E861 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sclt1G5E861 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sclt1G5E861 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sclt1G5E861 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Sclt1G5E861 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Sclt1G5E861 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Sclt1G5E861 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sclt1G5E861 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sclt1G5E861 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Sclt1G5E861 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sclt1G5E861 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sclt1G5E861 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sclt1G5E861 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Sclt1G5E861 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Sclt1G5E861 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Sclt1G5E861 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms