Protein–RNA interactions for Protein: G3UXD1

Speer4c, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4C, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4cG3UXD1 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Speer4cG3UXD1 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Speer4cG3UXD1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Speer4cG3UXD1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4cG3UXD1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4cG3UXD1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4cG3UXD1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4cG3UXD1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4cG3UXD1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Speer4cG3UXD1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58 ms