Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU2

Farp1, FERM, ARHGEF and pleckstrin domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Farp1F8VPU2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Farp1F8VPU2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Farp1F8VPU2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Farp1F8VPU2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Farp1F8VPU2 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Farp1F8VPU2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Farp1F8VPU2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Farp1F8VPU2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Farp1F8VPU2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Farp1F8VPU2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Farp1F8VPU2 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Farp1F8VPU2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Farp1F8VPU2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Farp1F8VPU2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Farp1F8VPU2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Farp1F8VPU2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Farp1F8VPU2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Farp1F8VPU2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Farp1F8VPU2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Farp1F8VPU2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Farp1F8VPU2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Farp1F8VPU2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Farp1F8VPU2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Farp1F8VPU2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Farp1F8VPU2 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms