Protein–RNA interactions for Protein: F6XX07

Gm21970, Predicted gene 21970 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21970F6XX07 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Gm21970F6XX07 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Gm21970F6XX07 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21970F6XX07 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21970F6XX07 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21970F6XX07 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21970F6XX07 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Gm21970F6XX07 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21970F6XX07 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21970F6XX07 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21970F6XX07 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gm21970F6XX07 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21970F6XX07 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21970F6XX07 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gm21970F6XX07 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21970F6XX07 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21970F6XX07 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gm21970F6XX07 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21970F6XX07 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21970F6XX07 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21970F6XX07 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gm21970F6XX07 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gm21970F6XX07 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21970F6XX07 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21970F6XX07 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21970F6XX07 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21970F6XX07 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gm21970F6XX07 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm21970F6XX07 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm21970F6XX07 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm21970F6XX07 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm21970F6XX07 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm21970F6XX07 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm21970F6XX07 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gm21970F6XX07 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm21970F6XX07 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm21970F6XX07 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm21970F6XX07 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm21970F6XX07 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm21970F6XX07 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm21970F6XX07 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm21970F6XX07 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gm21970F6XX07 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms