Protein–RNA interactions for Protein: F6XS56

Gm8444, Predicted gene 8444, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8444F6XS56 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8444F6XS56 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Gm8444F6XS56 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8444F6XS56 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8444F6XS56 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8444F6XS56 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8444F6XS56 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Gm8444F6XS56 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8444F6XS56 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8444F6XS56 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8444F6XS56 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8444F6XS56 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8444F6XS56 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Gm8444F6XS56 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8444F6XS56 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8444F6XS56 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8444F6XS56 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8444F6XS56 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Gm8444F6XS56 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Gm8444F6XS56 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Gm8444F6XS56 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Gm8444F6XS56 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Gm8444F6XS56 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms