Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Itga10E9Q6R1 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Itga10E9Q6R1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga10E9Q6R1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga10E9Q6R1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga10E9Q6R1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga10E9Q6R1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Itga10E9Q6R1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Itga10E9Q6R1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga10E9Q6R1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Itga10E9Q6R1 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga10E9Q6R1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga10E9Q6R1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga10E9Q6R1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga10E9Q6R1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga10E9Q6R1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga10E9Q6R1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Itga10E9Q6R1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga10E9Q6R1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga10E9Q6R1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga10E9Q6R1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga10E9Q6R1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Itga10E9Q6R1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga10E9Q6R1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Itga10E9Q6R1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Itga10E9Q6R1 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms