Protein–RNA interactions for Protein: E9Q612

Ptpro, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase O, mousemouse

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtproE9Q612 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PtproE9Q612 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtproE9Q612 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PtproE9Q612 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtproE9Q612 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PtproE9Q612 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtproE9Q612 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtproE9Q612 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtproE9Q612 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PtproE9Q612 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtproE9Q612 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtproE9Q612 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtproE9Q612 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PtproE9Q612 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtproE9Q612 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtproE9Q612 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PtproE9Q612 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtproE9Q612 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtproE9Q612 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtproE9Q612 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PtproE9Q612 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PtproE9Q612 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PtproE9Q612 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtproE9Q612 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PtproE9Q612 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtproE9Q612 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtproE9Q612 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PtproE9Q612 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtproE9Q612 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PtproE9Q612 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PtproE9Q612 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PtproE9Q612 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtproE9Q612 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PtproE9Q612 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtproE9Q612 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtproE9Q612 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PtproE9Q612 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtproE9Q612 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtproE9Q612 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PtproE9Q612 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PtproE9Q612 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PtproE9Q612 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms