Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5R7

Nlrp12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp12E9Q5R7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp12E9Q5R7 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp12E9Q5R7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp12E9Q5R7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nlrp12E9Q5R7 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nlrp12E9Q5R7 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nlrp12E9Q5R7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Nlrp12E9Q5R7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrp12E9Q5R7 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrp12E9Q5R7 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nlrp12E9Q5R7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp12E9Q5R7 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp12E9Q5R7 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp12E9Q5R7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp12E9Q5R7 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Nlrp12E9Q5R7 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.3 ms