Protein–RNA interactions for Protein: E9Q5K9

Ythdc1, YTH domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ythdc1E9Q5K9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Ythdc1E9Q5K9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Ythdc1E9Q5K9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ythdc1E9Q5K9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Ythdc1E9Q5K9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ythdc1E9Q5K9 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ythdc1E9Q5K9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ythdc1E9Q5K9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ythdc1E9Q5K9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ythdc1E9Q5K9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ythdc1E9Q5K9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ythdc1E9Q5K9 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ythdc1E9Q5K9 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
Ythdc1E9Q5K9 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ythdc1E9Q5K9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ythdc1E9Q5K9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ythdc1E9Q5K9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ythdc1E9Q5K9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Ythdc1E9Q5K9 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ythdc1E9Q5K9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ythdc1E9Q5K9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ythdc1E9Q5K9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ythdc1E9Q5K9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ythdc1E9Q5K9 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Ythdc1E9Q5K9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ythdc1E9Q5K9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms