Protein–RNA interactions for Protein: E9Q4Y8

8030474K03Rik, RIKEN cDNA 8030474K03 gene, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
8030474K03RikE9Q4Y8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
8030474K03RikE9Q4Y8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
8030474K03RikE9Q4Y8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
8030474K03RikE9Q4Y8 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
8030474K03RikE9Q4Y8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
8030474K03RikE9Q4Y8 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
8030474K03RikE9Q4Y8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
8030474K03RikE9Q4Y8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms