Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1W3

Neb, Nebulin, mousemouse

Predictions only

Length 7,152 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NebE9Q1W3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC6.57□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC6.57□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.57□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC6.56□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC6.56□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC6.56□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC6.55□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.55□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.54□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC6.54□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.54□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC6.53□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC6.53□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC6.53□□□□□ -1.36
NebE9Q1W3 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC6.52□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC6.52□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.52□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC6.51□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC6.51□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC6.51□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC6.5□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.5□□□□□ -1.37
NebE9Q1W3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.5□□□□□ -1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 531.2 ms