Protein–RNA interactions for Protein: E9PUL3

Clca3b, Chloride channel accessory 3B, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3bE9PUL3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Clca3bE9PUL3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clca3bE9PUL3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Clca3bE9PUL3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clca3bE9PUL3 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Clca3bE9PUL3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clca3bE9PUL3 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clca3bE9PUL3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clca3bE9PUL3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clca3bE9PUL3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Clca3bE9PUL3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clca3bE9PUL3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clca3bE9PUL3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clca3bE9PUL3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Clca3bE9PUL3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clca3bE9PUL3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clca3bE9PUL3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Clca3bE9PUL3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clca3bE9PUL3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clca3bE9PUL3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Clca3bE9PUL3 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Clca3bE9PUL3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clca3bE9PUL3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Clca3bE9PUL3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Clca3bE9PUL3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Clca3bE9PUL3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms