Protein–RNA interactions for Protein: D3YZV8

Ccdc8, Coiled-coil domain-containing protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc8D3YZV8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc8D3YZV8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ccdc8D3YZV8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ccdc8D3YZV8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccdc8D3YZV8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccdc8D3YZV8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.4 ms