Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Samd1D3YXK1 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Samd1D3YXK1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Samd1D3YXK1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Samd1D3YXK1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83 ms