Protein–RNA interactions for Protein: C6KI89

Catsperg2, Cation channel sperm-associated protein subunit gamma 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsperg2C6KI89 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Catsperg2C6KI89 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Catsperg2C6KI89 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Catsperg2C6KI89 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Catsperg2C6KI89 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Catsperg2C6KI89 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms