Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AU015836B2RUM3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
AU015836B2RUM3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
AU015836B2RUM3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
AU015836B2RUM3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms