Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
CK137956B1AYM9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
CK137956B1AYM9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
CK137956B1AYM9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CK137956B1AYM9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms