Protein–RNA interactions for Protein: B1AUS7

Ssxa1, Protein SSXA1, mousemouse

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Length 101 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxa1B1AUS7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssxa1B1AUS7 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssxa1B1AUS7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssxa1B1AUS7 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssxa1B1AUS7 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssxa1B1AUS7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssxa1B1AUS7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssxa1B1AUS7 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssxa1B1AUS7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssxa1B1AUS7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssxa1B1AUS7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ssxa1B1AUS7 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssxa1B1AUS7 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssxa1B1AUS7 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssxa1B1AUS7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ssxa1B1AUS7 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ssxa1B1AUS7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ssxa1B1AUS7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ssxa1B1AUS7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 133.9 ms