Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
Grik3B1AS29 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Grik3B1AS29 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Grik3B1AS29 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Grik3B1AS29 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grik3B1AS29 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grik3B1AS29 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Grik3B1AS29 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Grik3B1AS29 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Grik3B1AS29 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik3B1AS29 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik3B1AS29 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik3B1AS29 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Grik3B1AS29 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik3B1AS29 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik3B1AS29 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik3B1AS29 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik3B1AS29 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik3B1AS29 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik3B1AS29 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik3B1AS29 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Grik3B1AS29 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grik3B1AS29 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grik3B1AS29 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Grik3B1AS29 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Grik3B1AS29 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Grik3B1AS29 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik3B1AS29 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik3B1AS29 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik3B1AS29 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik3B1AS29 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Grik3B1AS29 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grik3B1AS29 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Grik3B1AS29 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grik3B1AS29 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Grik3B1AS29 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grik3B1AS29 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grik3B1AS29 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grik3B1AS29 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Grik3B1AS29 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik3B1AS29 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik3B1AS29 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik3B1AS29 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Grik3B1AS29 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Grik3B1AS29 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Grik3B1AS29 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grik3B1AS29 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Grik3B1AS29 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik3B1AS29 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik3B1AS29 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Grik3B1AS29 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grik3B1AS29 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Grik3B1AS29 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Grik3B1AS29 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms