Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9F4

Ttll11, Tubulin polyglutamylase TTLL11, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll11A4Q9F4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttll11A4Q9F4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttll11A4Q9F4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttll11A4Q9F4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttll11A4Q9F4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttll11A4Q9F4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttll11A4Q9F4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ttll11A4Q9F4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttll11A4Q9F4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttll11A4Q9F4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ttll11A4Q9F4 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttll11A4Q9F4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttll11A4Q9F4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttll11A4Q9F4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttll11A4Q9F4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ttll11A4Q9F4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttll11A4Q9F4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttll11A4Q9F4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ttll11A4Q9F4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttll11A4Q9F4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttll11A4Q9F4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttll11A4Q9F4 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Ttll11A4Q9F4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Ttll11A4Q9F4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ttll11A4Q9F4 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ttll11A4Q9F4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms