Protein–RNA interactions for Protein: A3KGA4

Tceal7, Transcription elongation factor A protein-like 7, mousemouse

Predictions only

Length 98 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tceal7A3KGA4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Tceal7A3KGA4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tceal7A3KGA4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tceal7A3KGA4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tceal7A3KGA4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms