Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
H2al1jA2BFR3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
H2al1jA2BFR3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al1jA2BFR3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al1jA2BFR3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al1jA2BFR3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al1jA2BFR3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
H2al1jA2BFR3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1jA2BFR3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1jA2BFR3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1jA2BFR3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1jA2BFR3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1jA2BFR3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1jA2BFR3 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1jA2BFR3 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
H2al1jA2BFR3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1jA2BFR3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
H2al1jA2BFR3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al1jA2BFR3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al1jA2BFR3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
H2al1jA2BFR3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms