Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC40.48■■■■■ 4.07
Frmpd1A2AKB4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC40.47■■■■■ 4.07
Frmpd1A2AKB4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Frmpd1A2AKB4 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC40.46■■■■■ 4.07
Frmpd1A2AKB4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Frmpd1A2AKB4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.44■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC40.43■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.43■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.42■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.41■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC40.4■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC40.4■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC40.39■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.39■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC40.39■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.06
Frmpd1A2AKB4 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Frmpd1A2AKB4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.38■■■■■ 4.05
Frmpd1A2AKB4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.38■■■■■ 4.05
Frmpd1A2AKB4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Frmpd1A2AKB4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Frmpd1A2AKB4 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC40.37■■■■■ 4.05
Frmpd1A2AKB4 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Frmpd1A2AKB4 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.35■■■■■ 4.05
Frmpd1A2AKB4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Frmpd1A2AKB4 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.35■■■■■ 4.05
Frmpd1A2AKB4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.34■■■■■ 4.05
Frmpd1A2AKB4 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.33■■■■■ 4.05
Frmpd1A2AKB4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.33■■■■■ 4.05
Frmpd1A2AKB4 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.05
Frmpd1A2AKB4 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC40.32■■■■■ 4.04
Frmpd1A2AKB4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.29■■■■■ 4.04
Frmpd1A2AKB4 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
Frmpd1A2AKB4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Frmpd1A2AKB4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Frmpd1A2AKB4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Frmpd1A2AKB4 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.27■■■■■ 4.04
Frmpd1A2AKB4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Frmpd1A2AKB4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC40.26■■■■■ 4.03
Frmpd1A2AKB4 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.25■■■■■ 4.03
Frmpd1A2AKB4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Frmpd1A2AKB4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Frmpd1A2AKB4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Frmpd1A2AKB4 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC40.23■■■■■ 4.03
Frmpd1A2AKB4 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.23■■■■■ 4.03
Frmpd1A2AKB4 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC40.22■■■■■ 4.03
Frmpd1A2AKB4 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Frmpd1A2AKB4 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Frmpd1A2AKB4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.22■■■■■ 4.03
Frmpd1A2AKB4 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Frmpd1A2AKB4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Frmpd1A2AKB4 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Frmpd1A2AKB4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC40.21■■■■■ 4.03
Frmpd1A2AKB4 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.2■■■■■ 4.03
Frmpd1A2AKB4 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Frmpd1A2AKB4 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC40.19■■■■■ 4.02
Frmpd1A2AKB4 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.17■■■■■ 4.02
Frmpd1A2AKB4 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.16■■■■■ 4.02
Frmpd1A2AKB4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Frmpd1A2AKB4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC40.15■■■■■ 4.02
Frmpd1A2AKB4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.15■■■■■ 4.02
Frmpd1A2AKB4 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC40.13■■■■■ 4.01
Frmpd1A2AKB4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC40.13■■■■■ 4.01
Frmpd1A2AKB4 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC40.11■■■■■ 4.01
Frmpd1A2AKB4 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.1■■■■■ 4.01
Frmpd1A2AKB4 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.09■■■■■ 4.01
Frmpd1A2AKB4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Frmpd1A2AKB4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Frmpd1A2AKB4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.08■■■■■ 4.01
Frmpd1A2AKB4 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC40.06■■■■■ 4
Frmpd1A2AKB4 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Frmpd1A2AKB4 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Frmpd1A2AKB4 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Frmpd1A2AKB4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.05■■■■■ 4
Frmpd1A2AKB4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Frmpd1A2AKB4 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Frmpd1A2AKB4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Frmpd1A2AKB4 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Frmpd1A2AKB4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Frmpd1A2AKB4 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.03■■■■■ 4
Frmpd1A2AKB4 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
Frmpd1A2AKB4 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC40.03■■■■■ 4
Frmpd1A2AKB4 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.02■■■■■ 4
Frmpd1A2AKB4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Frmpd1A2AKB4 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Frmpd1A2AKB4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC40.01■■■■■ 4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms