Protein–RNA interactions for Protein: A2AE42

Cyb561d1, Cytochrome b561 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyb561d1A2AE42 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyb561d1A2AE42 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Cyb561d1A2AE42 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cyb561d1A2AE42 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Cyb561d1A2AE42 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Cyb561d1A2AE42 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101 ms