Protein–RNA interactions for Protein: A2A9K7

Cnksr1, Connector enhancer of kinase suppressor of Ras 1, mousemouse

Predictions only

Length 700 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnksr1A2A9K7 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Cnksr1A2A9K7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnksr1A2A9K7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Cnksr1A2A9K7 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cnksr1A2A9K7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Cnksr1A2A9K7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cnksr1A2A9K7 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cnksr1A2A9K7 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Cnksr1A2A9K7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cnksr1A2A9K7 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Cnksr1A2A9K7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Cnksr1A2A9K7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cnksr1A2A9K7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cnksr1A2A9K7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cnksr1A2A9K7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cnksr1A2A9K7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cnksr1A2A9K7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cnksr1A2A9K7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Cnksr1A2A9K7 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cnksr1A2A9K7 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cnksr1A2A9K7 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Cnksr1A2A9K7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.2
Cnksr1A2A9K7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cnksr1A2A9K7 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cnksr1A2A9K7 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Cnksr1A2A9K7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cnksr1A2A9K7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Cnksr1A2A9K7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cnksr1A2A9K7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cnksr1A2A9K7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cnksr1A2A9K7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Cnksr1A2A9K7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnksr1A2A9K7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
Cnksr1A2A9K7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cnksr1A2A9K7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Cnksr1A2A9K7 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnksr1A2A9K7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnksr1A2A9K7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnksr1A2A9K7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnksr1A2A9K7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
Cnksr1A2A9K7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC28.65■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Cnksr1A2A9K7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cnksr1A2A9K7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cnksr1A2A9K7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cnksr1A2A9K7 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cnksr1A2A9K7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cnksr1A2A9K7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cnksr1A2A9K7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cnksr1A2A9K7 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cnksr1A2A9K7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cnksr1A2A9K7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cnksr1A2A9K7 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms