Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nlrp1bA1Z198 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nlrp1bA1Z198 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nlrp1bA1Z198 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Nlrp1bA1Z198 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Nlrp1bA1Z198 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 111.2 ms