Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RNP2

Uncharacterized protein (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 1,173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A0A0U1RNP2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
A0A0U1RNP2 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
A0A0U1RNP2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A0U1RNP2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A0U1RNP2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
A0A0U1RNP2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A0U1RNP2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
A0A0U1RNP2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A0U1RNP2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A0U1RNP2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A0U1RNP2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A0U1RNP2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
A0A0U1RNP2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A0U1RNP2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A0U1RNP2 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A0U1RNP2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
A0A0U1RNP2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0U1RNP2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
A0A0U1RNP2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
A0A0U1RNP2 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
A0A0U1RNP2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0U1RNP2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0U1RNP2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
A0A0U1RNP2 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A0U1RNP2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
A0A0U1RNP2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RNP2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RNP2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
A0A0U1RNP2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
A0A0U1RNP2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A0U1RNP2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A0U1RNP2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A0U1RNP2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A0U1RNP2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A0U1RNP2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A0U1RNP2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
A0A0U1RNP2 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
A0A0U1RNP2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
A0A0U1RNP2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
A0A0U1RNP2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A0U1RNP2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A0U1RNP2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A0U1RNP2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A0U1RNP2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A0U1RNP2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
A0A0U1RNP2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A0U1RNP2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A0U1RNP2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A0U1RNP2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
A0A0U1RNP2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0U1RNP2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0U1RNP2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0U1RNP2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
A0A0U1RNP2 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0U1RNP2 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0U1RNP2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0U1RNP2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
A0A0U1RNP2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0U1RNP2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0U1RNP2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
A0A0U1RNP2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
A0A0U1RNP2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
A0A0U1RNP2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.1 ms