Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WSG3

Gm28269, MCG1047152, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28269A0A087WSG3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,87■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,87■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,87■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,87■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC15,87■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15,87■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15,87■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,86■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,86■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15,86■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,86■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15,86■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,85■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,85■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,85■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,85■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,85■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,85■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC15,84■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,84■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,84■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,84■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,84■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,84■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,84■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,84■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,84■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,84■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15,84■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,83■□□□□ 0,13
Gm28269A0A087WSG3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15,83■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,83■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,83■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,83■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15,82■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,82■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC15,81■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15,81■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,81■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC15,81■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,81■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,81■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,81■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,8■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15,79■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,79■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,78■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,77■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC15,77■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,77■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,77■□□□□ 0,12
Gm28269A0A087WSG3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,77■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,77■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,76■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,76■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,76■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC15,76■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,76■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,76■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15,75■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15,75■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC15,75■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,75■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,74■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,74■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15,74■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15,74■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,74■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15,74■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC15,74■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,73■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,73■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,73■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15,73■□□□□ 0,11
Gm28269A0A087WSG3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,73■□□□□ 0,11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms