Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B6C2

Trav13-4-dv7, T cell receptor alpha variable 13-4-DV7 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,58■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,58■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,58■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,58■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC15,57■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15,57■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15,57■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,56■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,56■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,56■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,55■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15,55■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC15,55■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,55■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,54■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,53■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC15,53■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,53■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15,53■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,52■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC15,52■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,52■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC15,52■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15,52■□□□□ 0,08
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,52■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,51■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,51■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC15,51■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,51■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,51■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,5■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC15,5■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC15,5■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,5■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,49■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15,49■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15,49■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,49■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15,49■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,49■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,49■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC15,48■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15,48■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC15,48■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,48■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC15,48■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,47■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,46■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,46■□□□□ 0,07
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC15,45■□□□□ 0,06
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,45■□□□□ 0,06
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,45■□□□□ 0,06
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,44■□□□□ 0,06
Trav13-4-dv7A0A075B6C2 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15,44■□□□□ 0,06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms