Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z321

Top3b, DNA topoisomerase 3-beta-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3bQ9Z321 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Top3bQ9Z321 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms