Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1N5

Ddx39b, Spliceosome RNA helicase Ddx39b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx39bQ9Z1N5 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ddx39bQ9Z1N5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms