Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z123

Sema4f, Semaphorin-4F, mousemouse

Predictions only

Length 777 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4fQ9Z123 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Mllt11-201ENSMUST00000065482 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Mrpl55-204ENSMUST00000108786 757 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Dcp1b-201ENSMUST00000073909 1748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Sema4fQ9Z123 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms