Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sema6cQ9WTM3 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sema6cQ9WTM3 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms