Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1K7

Tubd1, Tubulin delta chain, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubd1Q9R1K7 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Tubd1Q9R1K7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.6 ms