Protein–RNA interactions for Protein: Q9R049

Amfr, E3 ubiquitin-protein ligase AMFR, mousemouse

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AmfrQ9R049 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
AmfrQ9R049 Arhgef18-201ENSMUST00000004684 5271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Nid1-201ENSMUST00000005532 6091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
AmfrQ9R049 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms