Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZE5

Copg1, Coatomer subunit gamma-1, mousemouse

Predictions only

Length 874 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copg1Q9QZE5 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Gm20324-201ENSMUST00000186291 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Copg1Q9QZE5 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms