Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYF1

Rdh11, Retinol dehydrogenase 11, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh11Q9QYF1 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Rdh11Q9QYF1 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.9 ms